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SAPOPEMA foi fundada em 2002 por professores, alunos e funcionários da Universidade Federal do Pará-UFPA Campus de Santarém. A primeira atividade científica foi a colaboração para o "Mapeamento e Diagnóstico da Biodiversidade do Parque Nacional da Amazônia e Florestas Nacionais de Itaituba I e II: subsídios para o plano de manejo", na região do médio rio Tapajós. Posteriormente, a SAPOPEMA iniciou seus trabalhos na região de várzea do Baixo Amazonas, onde desenvolve projetos em andamento. Nos últimos anos, SAPOPEMA tem trabalhado intensamente com as comunidades ribeirinhas buscando fortalecer o manejo sustentável da pesca e de outros recursos naturais na planície de inundação. Para isso, atualmente conta com diversos parceiros institucionais vinculados à atividade pesqueira do baixo Amazonas, como a MOPEBAM, as Colônias de Pescadores dos diferentes municípios e, principalmente, a Colônia Z-20 de Santarém, onde está localizada a sede da SAPOPEMA.



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